漂亮的 WB 條帶就像課題組的好男人,都說有但沒人見過,被傷害的碩博生繃不住了......
WB,一個科研界的「神級」實驗,擁有着非常獨特的品質:神秘、強大、有影響力。
神秘:漂亮的 WB 條帶就像鬼,人人都說有但是從來沒人在實驗室裡見過。
強大:很難被實驗技巧所幹預,身經百戰的科研老司機也會遭遇 WB 的背刺!
有影響力:影響範圍極其廣泛,從研一到博後,甚至導師面對之,也會望而卻步。
一次 WB 至少 36 個小時,曝光條帶「開盲盒」的時候,映入眼簾的往往是:髒背景、信號弱、大氣泡、歪條帶,甚至沒條帶.......
學霸君爲大家整理了 6 個異常條帶的原因以及修正策略。
文末還附上了科研人 WB 專項訓練,一週跟練,讓你的 WB 得到質的提升。
髒髒帶 —— 高背景條帶
來源:丁香實驗
高背景是 WB 中最常見的問題之一,它會嚴重干擾條帶的辨識。看着醜、ImageJ 也分析不出來,基本等於無用條帶。拿到它也就證明你浪費了寶貴的 36 小時。
可能原因 & 對策:
洗滌可能不充分:使用含 Tween-20 的 PBST 作爲洗滌液,增加洗滌次數至 3-5 次,每次 5 分鐘。
封閉不充分:嘗試使用 BSA 或其他低內毒素封閉液替代牛奶,減少非特異性結合。
抗體本身問題:實驗前對一抗進行預吸附處理,去除可能的交叉反應成分。* 選用純化抗原、過表達裂解物或同源蛋白填充柱/管,加入一抗孵育後離心或過濾,棄去溶液保留抗體,以此減少 WB 非特異性結合。
彎彎帶 —— 偏移條帶
來源:丁香實驗
有時,曝光後會突然出現凹凸不平或者偏移的條帶。這些條帶位置不準確的情況,常見於科研小白(或者讓小白幫你配膠的科研大佬)因爲這些條帶很可能是膠引起的。
可能原因 & 對策:
凝膠聚合不均勻:灌膠時候儘量混合均勻,動作輕緩。(見文末專項訓練)
分離膠凝固問題:凝固時可用 1 mL 無水乙醇覆蓋分離膠液麪,阻斷空氣,分隔線會更加平直,也會減少 「微笑」 或 「倒微笑」 等彎彎條帶的出現。
膠板底部有氣泡:這些氣泡會影響電泳效果,開始電泳前應傾斜電泳裝置,趕走氣泡。
淡淡帶 —— 很淡很淡的條帶
來源:丁香實驗
這種雜交信號很弱的條帶往往出自老司機之手,並非操作問題,而是蛋白量、抗體量、轉膜時間估算出現了問題。(不提前計算好時間、細節而盲目自信導致的)。
很可惜!這類條帶雖然能看出趨勢,但是對於數據統計和文章發表來說依舊不夠標準。
可能原因 & 對策:
蛋白量太少:可以適當增加蛋白上樣量(通常一孔 20-100μg 總蛋白)
抗體效價太低:可以適當加大抗體濃度,或者更換其他抗體過度漂洗膜:這也可能會導致信號變弱、條帶太淺;
轉移到膜上的蛋白太少:當蛋白分子量 <10 KD 時,可減少轉膜時間、使用小孔徑的膜或配置厚度適當的凝膠。
粘連帶 —— 連在一起的條帶
來源:丁香實驗
條帶連在一起,通常意味着實驗中存在一些「技術問題」,這樣的條帶降低了分辨率,不同孔的蛋白條帶無法清晰區分,基本無法統計。
以下是可能的原因及相應的對策:
可能原因 & 對策:
上樣量過大:減少上樣量至推薦範圍(通常 20-100μg 總蛋白),可先嚐試減半上樣量。
一抗孵育時間過長:縮短一抗孵育時間,一般 4°C 過夜較爲合適,或按抗體說明書推薦時間執行。
加樣孔殘留膠:拔梳子後徹底沖洗並吸乾加樣孔,避免膠殘留導致擴散。
上樣速度慢導致擴散:快速且均勻地上樣,減少樣品在孔口的停留時間。
APS(過硫酸銨)長時間存放:確保每次使用新配製的 APS,避免因降解導致的問題。
裝板不緊密:確保電泳膠與膜、膜與濾紙間裝配緊密,減少漏電。
點點帶 —— 出現黑點的模糊條帶
來源:丁香實驗
這類條帶的出現,可能與多種操作問題相關,包括抗體、轉膜、操作污染,需要一一排查。
可能原因 & 對策:
抗體沉澱:抗體使用前充分混勻並短暫離心,避免抗體顆粒形成。ECL 試劑不均:確保 ECL 試劑新鮮並均勻塗抹,可輕輕搖晃混合後再使用。
膜過於乾燥:在操作過程中保持膜溼潤,避免膜在空氣中暴露過久。抗體稀釋液問題:使用無菌、無顆粒的 PBS 或 TBST 稀釋抗體,確保溶液乾淨。
膜質量問題:更換高質量 PVDF 或 NC 膜,避免使用劣質或破損的膜。
操作污染:實驗全程戴手套,使用無菌操作,避免灰塵和異物落入。
泡泡帶 —— 出現氣泡、雜質的條帶
來源:丁香實驗
很多人認爲泡泡帶一定是轉膜時產生氣泡,但其實還可能有以下問題。
可能原因 & 對策:
轉膜時產生氣泡:轉膜前用緩衝液預溼膜,轉膜時緩慢放下,用吸水紙輕壓排出氣泡。
電泳膠不平整:確保凝膠和電泳槽底部貼合緊密,使用夾子固定,防止氣泡生成。
樣品含有顆粒:使用超聲波破碎或過濾樣品,去除顆粒物,確保樣品純淨。
封閉不充分:適當延長封閉時間,使用足夠的封閉液量,確保膜全面覆蓋。
沒有帶 —— 我條帶呢?
來源:丁香實驗
最後,很多同學可能會經歷沒有條帶的 WB 條帶,遇到這種問題可先別想着重新做實驗,把條帶丟掉,其實你的條帶可能還有救。
可能原因 & 對策:
抗體失效:驗證抗體活性,更換新批次抗體再試一次,如仍沒有條帶可能是以下問題。
電泳或轉膜失敗:檢查電泳緩衝液、凝膠濃度和轉膜時間,確保電泳和轉膜過程正常。
樣品降解:使用蛋白酶抑制劑,快速冷凍樣品,防止蛋白在提取和處理過程中降解。
膜過度清洗:減少洗滌次數或縮短每次洗滌時間,避免過度清洗導致信號減弱。
以上就是 6 個異常條帶的原因以及修正策略,掌握了上述策略,下一步就是將其轉化爲實際操作的肌肉記憶啦。
學霸君爲你設計了更具挑戰性和實用性的專項練習,快收藏本文,一起進步吧!
最後,請查收 WB 人一週專項訓練,跟着學霸君練起來!
週一:配膠 *3 板(8%、10%、12%),鍛鍊手部穩定性
週二:挑出最佳膠板跑膠 *1 次,計算電壓並記錄時間
週三:自己轉膜 *1 次;臨摹師兄師姐轉膜 *1 次
週四:1 分鐘速度疊船 *10 只(各種尺寸大小)
週五:休息日,檢查實驗筆記並覆盤。
相信我,連續堅持 3 周下來,你的 WB 也可以有質的提升。